Проникнув в компьютерную сеть полицейского управления Нью-Йорка, Шреддер подчиняет себе роботов-полицейских нового поколения. Чтобы остановить их, Черепашки вынуждены объединиться с "РЕКСом-1" - единственным роботом, не подвергшимся козням Шреддера.