Давным-давно, рассказывает анимационный фильм "Последний человек Атлантиды", верховный жрец Адишарна, в преддверии гибели Атлантиды, спрятал в мрамор бессмертия нескольких своих соплеменников, надеясь что они, спустя время, смогут вновь явить Атлантиду миру. В числе избранных был и молодой красавец Ихтиандр. Прошли тысячи лет, и профессор Айвор Брэнт, изучая морские глубины, нашел саркофаг и пробудил юношу от многовекового сна. Ихтиандр теперь живет в его доме, проводит много времени под водой и пытается вспомнить свое прошлое. А тем временем, жители маленького портового городка обеспокоены слухом о Морском дьяволе. Педро Зурита, местный охотник за жемчугом, хочет поймать Ихтиандра. Он надеется сделать из него ловца жемчуга и с его помощью разбогатеть. Уже много месяцев Зурита напрасно пытается завладеть сердцем красавицы Гуттиэре, используя при этом гнусные методы. Он разорил ее старика-отца, отобрал у того шхуну и теперь грозит присвоить себе магазинчик - все, что осталось у несчастной семьи. Однако Гуттиэре по-прежнему противится нежеланной свадьбе, предпочитая ей нищету и смерть. Однажды она случайно встречает Ихтиандра, и эта встреча дарит героине мультфильма "Последний человек Атлантиды" надежду на спасение. А перед юношей встает проблема нелегкого выбора. Ведь благодаря Гуттиэре он вспомнил, наконец, свое прошлое и свое предназначение. Как ему теперь поступить? Оставить людей и их проблемы и спрятаться до лучших времен в мрамор бессмертия или же потерять навсегда свою Атлантиду, стать простым смертным и обрести счастливую земную жизнь и любовь?