Джо Флэниган (Joe Flanigan) родился в Лос-Анджелесе 5 января 1967 года. В шестилетнем возрасте мальчик вместе с родителями переехал на ранчо неподалеку от Рено (Невада). Жизнь на свежем воздухе со своим хозяйством пришлась по душе семейству Фланиганов. Обучаться Джо отдали в охайскую школу-интернат (Калифорния), где он занимался до четырнадцати лет. Уже в школьные годы Флагиан принимал активное участие в самодеятельных театральных постановках. В пьесе Теннеси Уильямса "Трамвай Желание" он сыграл Стенли Ковальского. Затем Джо продолжил своё обучение в Колорадском университете, где получил степень по истории, и по программе обмена ездил на год в Париж. Годы в университете тоже были связаны со сценой. Здесь ему довелось сыграть роль Кориолана в шекспировской трагедии. Окончив колледж, Джо не сразу связал свою жизнь с кинематографом. Он перепробовал себя во многих областях - журналистике, банковском деле и даже политике, но ничто его особо не привлекало. После того, как Флэнигана уволили из журнала "Интервью", он стал безработным и переехал в Нью-Йорк. По соседству жил актёр, который как-то предложил ему попробовать себя в этом ремесле, и Джо рискнул. Фланиган стал обучаться в нью-йоркском окружном театре. Поначалу он работал на радио. В 1994 году его приглашают в мини-сериале на BC "Семейный альбом Даниэлы Стил". Лос-Анджелес стал его следующим пристанищем, где актер получил регулярную роль студента колледжа в сериале "Сестры" канала BC. Зрители полюбили молодого актёра и в сериале "Первый понедельник". После Джо получил приглашение в сериалы "Мерфи Браун", "Хищные птицы", "Справедливая Эми", "CSI: Майами", в нескольких сериях в "Купидоне", "Ручье Доусона", "Провиденсе" и "Профиле убийцы". Он сыграл ведущие роли в телевизионных фильмах "Не надо тайн" 1997), "Другая сестра" (1999). В 1995 году состоялся дебют Фланигана на большом экране в фильме "Повод для доверия". С 2004 по 2009 годы Джо играл роль майора Джона Шеппарда в сериале "Звездные Врата Атлантида". Джо Флангиан женат на художнице Кетрин, у них трое детей. Он обожает лыжи, езду на велосипеде, серфинг, альпинизм. Ненавидит морские прогулки, признаваясь, что самый большой кошмар для него - это очутиться одному в открытом море.