Саймон Уэллс родился в 1961 году в Кембридже (Великобритания). Правнук Герберта Уэллса. Профессиональное образование получил в Политехническом институте Лейчестера, где изучал аудиовизуальный дизайн. Затем Саймон Уэллс работал на студии аниматора Ричарда Уильямса, принимал участие в работе над фильмом "Кто подставил Кролика Роджера?" (1988). После этого художник перебрался в США, сотрудничал с Робертом Земекисом на съемках его сиквелов "Назад в будущее", работал на студии "Amblin". В 1991 году состоялся дебют Саймона Уэллса как режиссера - он был сопостановщиком анимационного фильма "Американский хвост". Затем последовали мультфильмы "История динозавра-2" (1993), "Болто" (1995), "Принц Египта" (1998). В 2002 году Саймон Уэллс выступил в качестве режиссера игрового фильма, поставив игровую крупнобюджетную научно-фантастическую картину "Машина времени". Правда, знаменитый роман его прадеда был несколько осовременен сценаристами.