Родился в Москве в 1957 году. В 1978 году окончил экономический факультет ВГИКа. В 1984-85 годах в качестве директора картины с российской стороны принимал участие в создании сериала "Петр Великий". С 1985 года работал директором картины на российских фильмах "ТАСС уполномочен заявить", "Клуб женщин" и т.д. В 1990 году Игорь Толстунов совместно с Валерием Тодоровским и Сергеем Ливневым основал студию "ТТЛ" и с 1991 по 1995 годы был ее исполнительным директором. В 1995 году стал генеральным директором кинокомпании "НТВ-Профит". В настоящее время является заместителем генерального директора телеканала "СТС" и генеральным продюсером фестиваля "Кинотавр".